PCR是分子生物學(xué)研究和實(shí)驗的常規方法，并沒(méi)有嚴格的凈化要求，但是為了避免各個(gè)試驗區域間交叉污染的可能性，宜采用全送全排式氣流組織形式。同時(shí)，要嚴格控制送、排風(fēng)的比例以保證各實(shí)驗區的壓力要求。
試劑貯存和準備區：
該實(shí)驗區主要進(jìn)行的操作作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。試劑和用于標本制作的材料應直接運送至該區，不得經(jīng)過(guò)其它區域。試劑原材料必須貯存在本區內，并在本區內制備成所需的貯存試劑。對氣流壓力的控制，本區并沒(méi)有嚴格的要求。
標本制備區：
該區域主要進(jìn)行的操作為臨床標本的保存、核酸（RNA、DNA）提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定RNA時(shí)cDNA的合成。本區的壓力梯度要求為相對于臨近區域為正壓，以避免從鄰近區域進(jìn)入本區的氣溶膠污染。另外，由于在加樣操作中可能會(huì )發(fā)生氣溶膠所致的污染，所以應避免在本區域內不必要的走動(dòng)。
擴增反應混合物配制和擴增區：
擴增反應混合物配制和擴增區：該區域主要進(jìn)行的操作為NDA或cDNA擴增。此外，已制備的DNA模板和合成的cDNA（來(lái)自樣本制備區）的加入和主反應混合液（來(lái)自試劑貯存和制備區）制備成反應混合液等也可以在本區域內進(jìn)行。在巢氏PCR測定中，通常在第一輪擴增后必須打開(kāi)反應管。因此巢氏擴增有較高的污染危險性，第二次加樣必須在本區域內進(jìn)行。本區的壓力梯度要求為：相對于鄰近區域為負壓，以避免氣溶膠從本區域漏出。為避免氣溶膠所致的污染，應盡量減少在本區內不必要的走動(dòng)。個(gè)別操作如加樣等應在超凈臺內進(jìn)行。
擴增產(chǎn)物分析區：
該區域主要進(jìn)行的操作為擴增片段的測定。如使用全自動(dòng)封閉分析儀器檢測，此區域可不設。本區是最主要的擴增產(chǎn)物污染來(lái)源，因此對本區的壓力梯度的要求為：相對于臨近區域為負壓，以避免擴增產(chǎn)物從本區域擴散至其它區域。
完備的實(shí)驗室配套設施：
完備的實(shí)驗室配套設施是保證實(shí)驗工作的必要條件，應根據各個(gè)實(shí)驗室實(shí)驗內容的不同配備相應的設備和儀器，如超凈工作臺、生物安全柜、離心機、加樣器等。
